La composition microscopique des boues activées:
- Les Bactéries constituent la principale faune biologique microscopique et dépend de la quantité de nourriture qui entre dans la station d'épuration; les bacilles aérobies et actifs sont fortement représentés (environ 10 milliards d'individus/ml) . Les principaux genres sont Arthrobacter, Aeromonas, Flavobacter, Pseudomonas, Achromobater et Alcaligenes.
- Les protozoaires (un demi million/ml) comprennent des
les holotriches
les hypotriches
les péritriches .
les zooflagellés
Ils équilibrent le nombre de bactéries en les assimilant, ce sont les prédateurs de la faune (bactéries et protozoaires)
- Les métazoaires sont constitués d'individus plus élaborés comme les rotifères et les nématodes. Ils ingurgitent matière organique et déchets de prédateurs et facilitent ainsi le bouclage du cycle en permettant aux bactéries de se développer.